next up previous
: Native Patterson の計算 : 分子置換法 - MolRep - : 分子置換法 - MolRep -

非対称単位中の分子数の見積り

まず,Mattews 係数($V_M$)を計算して,結晶中の非対称単位中に何分子存在し ているかをチェックする.

  1. Coordinate Utilities から Cell Content Analysisを 選択する.
  2. Mtz file と,Molecular weight of protein を入力.
  3. Run Now

結果は例えば,以下のように表示される.


For estimated protein molecular weight 22641.48
Nmol/asym  Matthews Coeff %solvent
  1         4.6             73.0
  2         2.3             46.0
  3         1.5             19.0
通常 $V_M$ は 1.7 $\sim$ 3.5 $^3$/Da 程度であるので,この場合は,非対 称単位中に 2分子存在していると考えるのが妥当ということが分る.



Nobuhisa Watanabe
平成13年10月24日