準備

最初に環境設定のために，source /XtalView.env を実行する．(sirius 等では. cshrc から実行されている /home/muser/.group_cshrc で実行されているはず．)

XtalView の GUI は，


% xtalmgr

で起動する．

**図 7:** Xtalmgr の初期ウィンドウ
$\resizebox{100mm}{!}{\includegraphics{xtalmgr.eps}}$

まず最初に試料結晶の空間群等の情報のファイルを作成する．

Project:に適当な名前を入力し， Edit ボタンを押す．あとは作業ディレクトリと Crystal を入力し Createボタンを押す． Crystal:の方も適当な名前を入力し， Edit ボタンを押す．

Project Editor，Crystal Editor の例は以下のようである．

**図 8:** Project Editor，Crystal Editor ウィンドウの例
$\resizebox{80mm}{!}{\includegraphics{proj-edit.eps}}$ $\resizebox{100mm}{!}{\includegraphics{cryst-edit.eps}}$

実際には /xtal_info に Project:に記述した名称の以下のようなファイルが作成される．


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name pho ACCD ph0054
cell 122.1299 122.1299 114.2791 90.0 90.0 90.0
spgp p3221 154 6 6 trigonal
symm x,y,z; -y,x-y,z+2/3; y-x,-x,z+1/3; y,x,-z; x-y,-y,1/3-z; -x,y-x,2/3-z.
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次の 2つのセクションは resolve 2.02 が自動トレースを実行し，初期モデル resolve.pdb が出来ている場合は，それをスタートモデルにすれば良いので不要．

Nobuhisa Watanabe
平成16年1月7日